交互式分子积木及分子积木交互系统的制作方法
本发明涉及积木,特别涉及一种交互式分子积木及分子积木交互系统。
背景技术:
当前用于研发和教学用的分子实体模型基本都是塑料或金属制成的球棍积木。这样的积木由不同大小的实体球(代表不同的原子)和不同长短的实体短棒(代表不同的化学键)构成。使用者可以根据目标分子的结构(包括内部由哪些原子,原子之间是怎样的化学键连接),来拼接积木,得到对应的实体化学分子结构模型。
当前的技术只是一个简单的积木,只能简单示意一下微观的分子结构被放大到积木大小时给使用者以直观感受。在实际研发中,需要结合计算机更精确的操作分子结构积木,并能与积木形成实时的反馈。比如,在药物分子研发过程中,分子内柔性角的转动会对分子本身的能量和稳定性产生非常大的影响。如果希望直观的看到最稳定的分子结构被真实放大后的情况,当前的技术就非常困难。
另一方面,之前这些研发操作都是直接通过计算机模拟完成的,这样使用者只能通过显示器看到一个虚拟的分子结构模型。这就需要使用者有较强的想象力,将虚拟场景在脑海中转化为实体的情形。而在实际研发和教学过程中,能真实触摸和操作的模型会更直观,达成的效果更好。
技术实现要素:
基于此,有必要提供一种可提高交互性的交互式分子积木。
同时,提供一种可提高交互性的晶体交互系统。
一种交互式分子积木,包括:控制插座模块、原子球模块、分子键模块,所述控制插座模块包括:插座本体、及设置在所述插座本体上的插座连接器,所述原子球模块包括:原子球本体、及设置在原子球本体上并与所述插座连接器配合的原子球连接器,所述原子球模块上设置有多个所述原子球连接器,所述分子键模块包括:常规分子键模块、与柔性分子键模块,所述常规分子键模块包括:单键模块、双键模块、三键模块,所述单键模块或双键模块或三键模块包括:常规分子键键体、及设置在所述常规分子键键体端部并与原子球连接器配合的常规分子键连接器,所述柔性分子键模块:柔性分子键键体、及设置在所述柔性分子键键体端部并与所述原子球连接器配合设置的柔性分子键连接器。
在优选的实施例中,所述插座本体中设置有控制模块、与所述控制模块连接并进行供电的电源、及与所述控制模块连接并受控进行通信的通信模块,所述插座连接器与所述控制模块连接。
在优选的实施例中,所述插座本体为中空结构,形成插座内腔;所述插座连接器包括:插座连接器本体、及设置在所述插座连接器本体上的插座插头挡板、及设置所述插座连接器本体一端的插座插头、及设置在插座插头一端的连接接口。
在优选的实施例中,所述原子球模块或分子键模块具有识别id,所述原子球模块还包括内置在原子球本体中的原子球处理模块,所述原子球连接器与所述原子球处理模块电性连接,所述原子球处理模块记录该原子球模块的识别id、属性、原子球连接器的坐标或位置。
在优选的实施例中,所述原子球本体为中空结构,所述原子球处理模块设置在中空结构中,所述原子球连接器包括:键口、及设置在所述键口内的插槽,所述键口之间的夹角不同以对应不同的分子键夹角,每个键口连接至所述原子球处理模块并设置有编号,所述原子球模块的属性包括:代表的原子。
在优选的实施例中,所述键口包括:第一键口u、第二键口d、第三键口n、第四键口s、第五键口w、第六键口e、第七键口105-1、第八键口105-2、第九键口107-1、第十键口107-2、第十一键口107-3、第十二键口109-2、第十三键口109-3、第十四键口109-4、第十五键口120-2、第十六键口120-3,所述原子球连接器的坐标包括:键口圆心在所述原子球本体的球面上的经纬度坐标,所述第一键口u的经纬度坐标为n90°/e0°,所述第二键口d的经纬度坐标为s90°/e0°,所述第三键口n的经纬度坐标为n0°/e180°,所述第四键口s的经纬度坐标为n0°/e0°,所述第五键口w的经纬度坐标为n0°/w90°,所述第六键口e的经纬度坐标为n0°/e90°,所述第七键口105-1的经纬度坐标为n37°30'/e90°,所述第八键口105-2的经纬度坐标为n37°30'/w90°,所述第九键口107-1的经纬度坐标为n30°/e120°,所述第十键口107-2的经纬度坐标为n30°/w120°,所述第十一键口107-3的经纬度坐标为n30°/e0°,所述第十二键口109-2的经纬度坐标为s19°28'/e30°,所述第十三键口109-3的经纬度坐标为s19°28'/w90°,所述第十四键口109-4的经纬度坐标为s19°28'/e150°,所述第十五键口120-2的经纬度坐标为n0°/w30°,所述第十六键口120-3的经纬度坐标为n0°/w150°。
在优选的实施例中,所述单键模块或双键模块或三键模块还包括:内置在常规分子键键体中的常规分子键处理模块,所述常规分子键连接器与所述常规分子键处理模块电性连接,所述常规分子键处理模块记录该常规分子键模块的识别id、属性,所述常规分子键键体与所述常规分子键连接器之间设置有常规分子键插头挡板,所述常规分子键键体为中空结构,所述常规分子键连接器包括:设置在所述常规分子键键体端部的分子键插头、及设置在所述分子键插头一端的连接接口。
在优选的实施例中,所述柔性分子键模块还包括:内置在柔性分子键键体中的有柔性分子键处理模块,所述柔性分子键处理模块记录该柔性分子键模块的识别id、属性,所述柔性分子键连接器与所述柔性分子键处理模块电性连接,所述柔性分子键键体一端与所述柔性分子键连接器之间设置有柔性分子键插头挡板,所述柔性分子键键体与另一个柔性分子键连接器连接的另一端设置有编码器,所述编码器与所述柔性分子键处理模块电性连接,所述柔性分子键键体为中空结构,所述柔性分子键连接器包括:设置在所述柔性分子键键体端部的柔性分子键插头、及设置在所述柔性分子键插头一端的连接接口。
一种分子积木交互系统,包括:
确定原子与分子键:检测通信连接的控制插座模块,检测与控制插座模块连接的原子球模块、原子球模块之间连接的分子键模块,检测原子球模块、分子键模块的识别id、属性,确定原子球模块代表的代表原子、分子键模块代表的分子键,分子键模块包括:常规分子键模块、与柔性分子键模块,常规分子键模块代表分子内两原子之间形成的分子键,柔性分子键模块代表分子内两原子之间的形成的柔性分子键,常规分子键模块包括:单键模块、双键模块、三键模块,单键模块代表单键,双键模块代表双键,三键模块代表三键,根据常规分子键模块的类型确定虚拟分子的常规分子键类型;
构建虚拟分子:检测分子键模块与原子球模块连接的原子球模块上的键口编号,根据键口编号确定键口坐标,根据键口坐标计算位置,根据原子球模块、分子键模块的属性、及分子键模块插入连接至原子球模块中的键口位置构建虚拟分子结构;
分析计算:根据构建的虚拟分子结构进行分析计算。
在优选的实施例中,还包括:断开显示:若检测到与控制插座模块连接的原子球模块或分子键模块断开,控制删除断开部分的显示,保留与所述控制插座模块连接部分的显示;所述确定原子与分子键还包括:检测柔性分子键模块的编码器,根据柔性分子键上的编码器读取柔性分子键模块的当前旋转角度,根据柔性分子键模块的旋转改变柔性分子键两端分子基团的相对夹角;所述原子球模块属性包括:代表的原子,所述分子键模块属性包括:代表的分子键类型。
上述交互式分子积木及分子积木交互系统的分子键模块包括:常规分子键模块、与柔性分子键模块,通过设置柔性分子键模块支持分子内柔性分子键角度的精确数字化度量,分子模型内部各原子球模块和分子键模块之间的通信,同时,也通过控制插座模块实现了分子模型和交互系统之间的交互通信,分子模型和交互系统中的虚拟模型就实现了数字孪生,使用者操作实体模型时,交互系统中就会实时进行模拟,并支持分子能量的计算;使用者可以通过这套积木精确操作分子结构,并实时在软件中得到反馈,极大的提升了研发和教学的质量和效率。
附图说明
图1为本发明一实施例的交互式分子积木的控制插座模块的部分结构示意图;
图2为本发明一实施例的交互式分子积木的原子球模块的部分结构示意图;
图3为本发明一实施例的交互式分子积木的常规分子键模块的部分结构示意图;
图4为本发明一实施例的交互式分子积木的柔性分子键模块的部分结构示意图。
具体实施方式
如图1至图4所示,本发明一实施例的交互式分子积木包括:控制插座模块20、原子球模块40、分子键模块。
控制插座模块20包括:插座本体22、及设置在插座本体22上的插座连接器24。
进一步,本实施例的插座本体22为中空结构,形成插座内腔222。
进一步,本实施例的插座本体22中设置有控制模块、与控制模块连接并进行供电的电源、及与控制模块连接并受控进行通信的通信模块。本实施例中,优选的,通信模块可以为蓝牙模块。本实施例的插座连接器与控制模块连接。
进一步,本实施例的插座连接器24包括:插座连接器本体242、设置插座连接器本体242一端的插座插头244、及设置在插座插头244一端的连接接口246、及设置在插座连接器本体242与插座插头244之间的插座插头挡板248。本实施例的连接接口246优选为type-c接口。
控制插座模块20是整个积木的控制和与软件系统交互的关键部件。控制插座20的主体的外形可以是方体、球体等其他形状。控制插座模块20内部是中空的,内置电路板、电池以及蓝牙模块。控制插座模块20的插座本体22外有一个伸出来的圆柱形的插座连接器24插座连接器24的端部安装type-c接口。后面介绍的原子球有与之对应的键口插座。
原子球模块40就可以直接插在插座连接器24,通过type-c接口进行通信。插座连接器24的插座连接器本体242上设置插座插头挡板248防止插入的时候用力过大损坏type-c接口和其他通信线路的。
本实施例的控制插座模块20通过type-c连接接口采集连接的原子球模块40、分子键模块包括常规分子键模块62和柔性分子键模块64的数据信息,然后将数据汇总后通过蓝牙实时发送给配套的软件系统。这样软件系统就可以实时构建和更新虚拟的分子结构,并对分子的能量进行计算。
本实施例的交互式分子积木的每个积木有内置的芯片,芯片内会记录这个积木的一个唯一的识别id(identitydocument,身份标识号码),以及这个积木的属性。
可通过代码或字母表示不同的积木类型属性如用a表示原子球模块,b表示分子键模块。
原子球模块属性,如果积木类型属性为a,原子球模块属性为代表的原子如原子的字母代号,比如氢为h,碳为c,氧为o;如果积木类型属性为b,则该属性为null。
分子键模块属性,如果积木类型属性为b,且该积木为常规分子键模块,则属性为n;该积木为柔性分子键模块,则属性为r。如果积木类型属性为a,则该属性为null。
当积木插到控制控制插座模块20上或控制插座模块20连接的其他积木上,控制插座模块20会读出这个积木的id和其积木的属性。通过积木的属性,系统可以判断出插入的是什么原子,以及是什么分子键。
如图2所示,进一步,本实施例的原子球模块40包括:原子球本体42、及设置在原子球本体42上并与插座连接器24配合的原子球连接器44。原子球模块40上设置有多个原子球连接器44。原子球模块具有识别id。
进一步,本实施例的原子球模块40还包括:内置在原子球本体42中的原子球处理模块。原子球处理模块记录该原子球模块的识别id、属性、原子球连接器的坐标或位置。原子球连接器44与原子球处理模块电性连接。
进一步,本实施例的原子球本体42为中空结构。原子球处理模块设置在中空结构中。原子球连接器44包括:键口、及设置在键口内的插槽。键口之间的夹角不同以对应不同的分子键夹角。每个键口连接至原子球处理模块并设置有编号。原子球模块的属性包括:代表的原子。
可以通过积木属性判断出不同的原子。
原子球模块40上的键口都有编号,这些键口的电路会连接到原子球处理模块的芯片上,并与之编号一一对应。如果一个键口插入了分子键模块,则芯片会将对应的键口编号和插入状态发送给系统。系统通过不同的键口编号可以根据其经纬度坐标计算出不同的位置。
原子球模块40是一组代表分子内部原子的球体结构。这一组球的构造是一致的,代表不同原子的球的尺寸会有差异。在实际使用中,代表各原子的球的尺寸比例可以按照原子半径的比例来制造。这一组球的个数没有什么限制,可根据分子内原子的数量和需要组装的分子数量来按需生产。本实施例的键口为圆柱形并于原子球本体42的球表面有向内凹。本实施例的插槽优选为type-c插槽。每个键口内有type-c插槽。
常规分子键模块和柔性分子键模块可以直接插入键口,然后通过type-c连接接口通信。各键口之间的夹角度数不同,对应了不同的分子键夹角。本实施例的键口包括可组成常见分子键角的16个键口。如果在使用中需要的其他特殊角度,也可以按同样的设计增加相应的键口。
表一:本实施例的键口在原子球本体42的球面上的分布如下:
表二:键口对应的常见分子键角的详细说明如下:
原子球模块40的球内是中空的,内置电路板,用于处理各键口type-c接口的信息。控制插座模块20的插座插头244可以插入任一键口内,原子球模块40通过type-c接口向控制插座模块20传递信息。
进一步,本实施例的分子键模块具有识别id。分子键模块包括:常规分子键模块62、与柔性分子键模块64。
如图3所示,常规分子键模块62包括:单键模块、双键模块、三键模块。单键模块或双键模块或三键模块包括:常规分子键键体622、及设置在常规分子键键体端部622并与原子球连接器配合的常规分子键连接器624。
单键模块或双键模块或三键模块还包括:内置在常规分子键键体622中的常规分子键处理模块。常规分子键连接器624与常规分子键处理模块电性连接。常规分子键处理模块记录该常规分子键模块的识别id、属性。常规分子键键体为中空结构。
进一步,本实施例的常规分子键键体622与常规分子键连接器624之间设置有常规分子键插头挡板626。
进一步,本实施例的常规分子键连接器624:设置在常规分子键键体622端部的分子键插头6242、及设置在分子键插头6242一端的连接接口6244。
本实施例的常规分子键模块62为圆柱形,代表分子内两个原子之间形成的分子键。常规分子键键体为中空结构,内置电路板。常规分子键键体622两端都设置有常规分子键连接器624,两端都装有type-c接口,当分子键插头6242插入原子球模块40的键口后,原子球模块40和常规分子键模块62可以通过type-c接口进行通信。常规分子键模块62的两端分别有一个常规分子键插头挡板626,防止插入的时候用力过大损坏type-c接口和其他通信线路的。
常规分子键模块62可根据实际分子键的长短比例和键的类型(如单键、双键、三键),生产不同长度和粗细的键体。如可将单键、双键、三键可以按粗细1:2:3的比例生产。
如图4所示,进一步,本实施例的柔性分子键模块64:柔性分子键键体642、及设置在柔性分子键键体642端部并与原子球连接器配合设置的柔性分子键连接器644。
进一步,本实施例的柔性分子键模块64还包括:内置在柔性分子键键体642中的有柔性分子键处理模块。
本实施例的柔性分子键处理模块记录该柔性分子键模块的识别id、属性。柔性分子键连接器644与柔性分子键处理模块电性连接。
进一步,本实施例的柔性分子键键体642一端与柔性分子键连接器644之间设置有柔性分子键插头挡板646。柔性分子键键体642与另一个柔性分子键连接器644连接的另一端设置有编码器648。编码器648与柔性分子键处理模块电性连接。优选的,本实施例的编码器为绝对编码器。柔性分子键键体642为中空结构。柔性分子键连接器644包括:设置在柔性分子键键体642端部的柔性分子键插头6442、及设置在柔性分子键插头6442一端的连接接口6444。优选的,本实施例的柔性分子键连接器644的连接接口6444为type-c接口。
本实施例的柔性分子键模块为圆柱形,代表分子内两个原子之间形成的柔性分子键。
柔性分子键是分子内可旋转的单键。通常当两个原子之间形成σ键的时候,键两端的基团可以沿着键轴旋转,形成不同的分子构象。
本实施例的柔性分子键模块的的构造与常规分子键模块基本相同。区别在于在柔性分子键模块的一端于柔性分子键插头挡板646的位置安装了一个绝对编码器。
旋转编码器测量旋转角度。绝对值旋转编码器光码盘上有许多道光通道刻线,每道刻线依次以2线、4线、8线、16线编排,这样,在编码器的每一个位置,通过读取每道刻线的通、暗,获得一组从2的零次方到2的n-1次方的唯一的2进制编码(格雷码),这就称为n位绝对编码器。这样的编码器是由光电码盘进行记忆的。
绝对编码器由机械位置确定编码,它无需记忆,无需找参考点,而且不用一直计数,什么时候需要知道位置,什么时候就去读取它的位置。这样,编码器的抗干扰特性、数据的可靠性大大提高了。
从单圈绝对值编码器到多圈绝对值编码器,绝对值旋转单圈绝对值编码器,以转动中测量光电码盘各道刻线,以获取唯一的编码,当转动超过360度时,编码又回到原点,这样就不符合绝对编码唯一的原则,这样的编码只能用于旋转范围360度以内的测量,称为单圈绝对值编码器。
绝对值旋转编码器的内侧装有一个零度标记指针649,柔性分子键键体642上有与之对应的0~360度的刻度。编码器可以沿柔性分子键键体642的轴旋转,在初始状态,柔性分子键键体642上的零度标记指针指向0,这是编码器的角度读数也是0。在使用过程中,使用者可以旋转编码器,编码器连接的一端键体会与另一端键体形成旋转角度,这个角度可以从编码器中读出。
本发明的配套的软件系统可以安装在计算机上或手机上。软件通过计算机或手机的蓝牙模块接收控制插座模块20传来的信息,完成设备与软件之间的通信。
配套的软件可以实时显示当前控制插座模块20上连接的原子球模块和分子键模块(包括这些原子球模块和分子键模块连接的其他原子球模块和分子键模块)。
配套的软件内置分子能量计算模块,支持用力场、半经验方法和高精度量子化学方法计算能量。
配套的软件系统可以安装在计算机上或手机上。软件通过计算机或手机的蓝牙模块接收控制插座传来的信息,完成设备与软件之间的通信。
配套的软件可以实时显示当前控制插座模块上连接的原子球模块和分子键模块(包括这些原子球模块和分子键模块连接的其他原子球模块和分子键模块)。
配套的软件内置分子能量计算模块,支持用力场、半经验方法和高精度量子化学方法计算能量。
当使用者需要搭建分子模型时,首先需要从分子内的所有原子中选择一个合适作为初始位置的原子。选择没有特定的要求,但从使用便捷性考虑,建议选择最边缘,键连最少的原子作为初始原子。
选好初始原子后,取一个原子球模块,根据原子的类型和键角的类型,确定需要使用的键口(确定规则见表2)。然后将任意一个非使用的键口插入到控制插座模块上。这时,控制插座模块通过type-c接口获取到模型插入了一个原子球模块,并会将这个信息传输给配套软件。配套软件会在界面上显示一个原子球。使用者可以在软件中编辑这个原子球模块对应的原子类型,与目标分子一致。
接下来根据这个原子与其他原子之间的分子键的类型,选取相应的分子键模块。如果是柔性键,就选择柔性分子键模块,其他类型的键选择常规分子键模块。然后根据上一步确定好的键口,将分子键模块插入原子球模块的键口内。这时,这个原子球模块会将插入分子键的键口编号发给控制插座模块,控制插座模块会将信息发给配套软件。软件会在界面上显示这个些分子键模块插在了原子球模块上。使用者可以在软件中编辑这些分子键对应的键类型,与目标分子一致。按目标分子内原子和分子键的组合方式重复上述过程,直到整个分子模型组装完成。
如果将分子键模块从原子球模块40的键口内拔出,则与控制插座模块相连部分的原子球模块40或分子键模块会通过连接向控制插座模块20发出断开连接的信号,这时软件系统会删除断开部分的显示,只保留连接在控制插座模块20部分的分子基团的显示。
如果搭建好的分子模型中包括了柔性分子键模块,使用者可以通过绕键轴旋转柔性分子键模块来改变两端分子基团的相对夹角。使用者在旋转的时候,编码器会实时读取当前旋转的角度,并通过type-c接口一路将信息传输给控制插座模块。控制插座模块将信息传输给配套软件,软件会按柔性键模块的旋转角度,更新显示出来。
当使用者搭好分子模型后,可以通过配套软件启动分子能量计算功能。这时软件会根据当前分子模型的三维结构计算能量。如果使用者旋转模型中的柔性分子键时,软件会根据转动的角度实时调整模拟的分子模型的三维结构,并计算能量。
本发明一实施例的分子积木交互系统,包括:
确定原子与分子键:检测通信连接的控制插座模块,检测与控制插座模块连接的原子球模块、原子球模块之间连接的分子键模块,检测原子球模块、分子键模块的属性,确定原子球模块代表的代表原子、分子键模块代表的分子键,分子键模块包括:常规分子键模块、与柔性分子键模块,常规分子键模块代表分子内两原子之间形成的分子键,柔性分子键模块代表分子内两原子之间的形成的柔性分子键,常规分子键模块包括:单键模块、双键模块、三键模块,单键模块代表单键,双键模块代表双键,三键模块代表三键,根据常规分子键模块的类型确定虚拟分子的常规分子键类型;
构建虚拟分子:检测分子键模块与原子球模块连接的原子球模块上的键口编号,根据键口编号确定键口坐标,根据键口坐标计算位置,根据原子球模块、分子键模块的属性、及分子键模块插入连接至原子球模块中的键口位置构建虚拟分子结构;
分析计算:根据构建的虚拟分子结构进行分析计算。
进一步,本实施例的确定原子与分子键还包括:检测柔性分子键模块的编码器,根据柔性分子键上的编码器读取柔性分子键模块的当前旋转角度,根据柔性分子键模块的旋转改变柔性分子键两端分子基团的相对夹角。
原子球模块属性包括:代表的原子,所述分子键模块属性包括:代表的分子键类型。
本实施例的分子积木交互系统可以根据当前控制插座模块上连接的原子球模块和分子键模块(包括这些原子球模块和分子键模块连接的其他原子球模块和分子键模块)实时显示构建的虚拟分子结构。
本实施例的分子积木交互系统内置分子能量计算模块,支持用力场、半经验方法和高精度量子化学方法计算能量。
当使用者需要搭建分子模型时,首先需要从分子内的所有原子中选择一个合适作为初始位置的原子。选择没有特定的要求,可以从使用便捷性考虑,建议选择最边缘,键连最少的原子作为初始原子。
选好初始原子后,取一个原子球,根据原子的类型和键角的类型,确定需要使用的键口(确定规则见表2)。然后将任意个非使用的原子球模块40的键口插入到控制插座模块20上。这时,控制插座模块通过type-c接口获取到模型插入了一个原子球模块,并会将这个信息传输分子积木交互系统,分子积木交互系统会在界面上显示一个原子球。使用者可以在分子积木交互系统中编辑这个原子球对应的原子类型,与目标分子一致。
根据这个原子与其他原子之间的分子键的类型,选取相应的分子键模块。如果是柔性分子键,就选择柔性分子键模块64,其他类型的键选择常规分子键模块62。然后根据上一步确定好的键口,将分子键模块插入原子球模块40的键口内。这时,这个原子球模块40会将插入分子键模块的键口编号发给控制插座模块20,控制插座模块20会将信息发给分子积木交互系统。分子积木交互系统会在界面上根据这个些分子键模块插在了原子球模块40上显示这个些分子键插在了原子上。使用者可以在分子积木交互系统中编辑这些分子键对应的键类型,与目标分子一致。按目标分子内原子和分子键的组合方式重复上述过程,直到整个分子模型组装完成。
如果将分子键模块从原子球模块40的键口内拔出,则与控制插座模块相连部分的原子球模块或分子键模块会通过连接向控制插座模块发出断开连接的信号,这时分子积木交互系统会删除断开部分的显示,只保留连接在控制插座模块的分子基团的显示。
如果搭建好的分子模型中包括了柔性分子键,使用者可以通过绕键轴旋转柔性分子键模块64来改变两端分子基团的相对夹角。使用者在旋转的时候,编码器会实时读取当前旋转的角度,并通过type-c接口一路将信息传输给控制插座模块。控制插座模块将信息传输给分子积木交互系统,分子积木交互系统会根据柔性分子键模块64的旋转控制旋转相应的柔性键的至相应角度,更新显示出来。
当使用者搭好分子模型后,可以通过分子积木交互系统启动分子能量计算功能。这时分子积木交互系统会根据当前分子模型的三维结构计算能量。如果使用者旋转模型中的柔性分子键模块64时,分子积木交互系统会根据柔性分子键模块64的转动角度实时调整模拟的分子模型的三维结构,并计算能量。
分子积木交互系统通过获取控制插座模块20上连接的原子球模块40和分子键模块的id,积木属性和插入的键口位置,直接构建出虚拟的分子结构。虚拟分子结构可以以mol文件的格式存储的,这个mol文件记载需要计算的全部信息。
分子能量计算支持可以基于分子力场的能量计算方法和基于第一性原理的量子化学计算方法。分子力场计算能量的常用工具包括amber、charmm等,量子化学计算能量的常用工具包括gaussian,psi4等。
本发明实现了分子模型内部各原子球模块和分子键模块之间的通信,并支持了分子内柔性分子键角度的精确数字化度量。同时,也通过控制插座模块20实现了分子模型和软件系统之间的交互通信。这样分子模型和软件系统中的虚拟模型就实现了数字孪生,使用者操作实体模型时,软件系统中就会实时进行模拟,并支持分子能量的计算。使用者可以通过这套积木精确操作分子结构,并实时在软件中得到反馈,极大的提升了研发和教学的质量和效率。
以上述依据本申请的理想实施例为启示,通过上述的说明内容,相关工作人员完全可以在不偏离本项申请技术思想的范围内,进行多样的变更以及修改。本项申请的技术性范围并不局限于说明书上的内容,必须要根据权利要求范围来确定其技术性范围。
本领域内的技术人员应明白,本申请的实施例可提供为方法、系统、或计算机程序产品。因此,本申请可采用完全硬件实施例、完全软件实施例、或结合软件和硬件方面的实施例的形式。而且,本申请可采用在一个或多个其中包含有计算机可用程序代码的计算机可用存储介质(包括但不限于磁盘存储器、cd-rom、光学存储器等)上实施的计算机程序产品的形式。
本申请是参照根据本申请实施例的方法、设备(系统)、和计算机程序产品的流程图和/或方框图来描述的。应理解可由计算机程序指令实现流程图和/或方框图中的每一流程和/或方框、以及流程图和/或方框图中的流程和/或方框的结合。可提供这些计算机程序指令到通用计算机、专用计算机、嵌入式处理机或其他可编程数据处理设备的处理器以产生一个机器,使得通过计算机或其他可编程数据处理设备的处理器执行的指令产生用于实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能的装置。
这些计算机程序指令也可存储在能引导计算机或其他可编程数据处理设备以特定方式工作的计算机可读存储器中,使得存储在该计算机可读存储器中的指令产生包括指令装置的制造品,该指令装置实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能。
这些计算机程序指令也可装载到计算机或其他可编程数据处理设备上,使得在计算机或其他可编程设备上执行一系列操作步骤以产生计算机实现的处理,从而在计算机或其他可编程设备上执行的指令提供用于实现在流程图一个流程或多个流程和/或方框图一个方框或多个方框中指定的功能的步骤。
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