一种CRISPR/Cas9基因载体、其制备方法及应用与流程
2021-02-02 09:02:25|481|起点商标网
一种crispr/cas9基因载体、其制备方法及应用
技术领域
[0001]
本发明属于生物技术领域,提供了一种crispr/cas9基因载体、其制备方法及应用。
技术背景
[0002]
人类许多重大疾病的发生均与基因缺陷有关,包括绝大部分遗传病、镰刀型细胞贫血症、糖尿病、肿瘤等。目前传统化疗或手术治疗仍然不能有效治愈这些重大疾病,基因治疗被认为是治疗这些重大疾病的有效手段。crispr/cas9基因编辑技术因高效靶向性、操作简便的优势,成为治疗基因疾病的研究热点。
[0003]
常用的基因载体有两类:病毒载体与非病毒载体。目前crispr/cas9系统的传递多采用慢病毒载体以提高基因的转染效率,从而确保crispr/cas9系统实现其基因编辑的目的。但是慢病毒载体倾向于插入宿主基因组的高表达区域,有较强的致癌、致突变性,目前已经停止临床应用。同时病毒载体的靶向性不强,制备过程复杂,成本较高等缺陷也限制了其临床应用。非病毒载体的生物安全性与靶向性较高,但是没有基因组整合能力,转染效率较低,表达时效短,无法满足crispr/cas9系统传递的需要。
[0004]
本发明制备一种新型非病毒基因载体,该载体能将crispr/cas9基因靶向传递至肿瘤细胞,再靶向传递至细胞核,并通过转座子将crispr/cas9基因整合至宿主基因组,实现对目的基因的高效敲除。首先,将crispr/cas9基因克隆至“睡美人”转座子中得到pt2spcas9重组质粒,然后设计靶向特定基因(如:nanog基因)的sgrna并插入pt2spcas9中得到pt2spcas9-nanog重组质粒。利用睡美人转座子的转座能力,提高将目的基因插入宿主基因组的整合效率,尤其是对于难以转染的祖细胞、干细胞、生殖细胞等,使转基因表达可以稳定的遗传到子代,提高crispr/cas9系统的基因编辑效率。为了将pt2spcas9基因靶向递送至细胞,本发明制备聚多巴胺(polydopamine,pda)纳米粒,在其表面修饰聚乙烯亚胺(polyethyleneimine,pei)。将地塞米松(dexamethasone,dex)通过π-π共轭负载至pda表面,使载体具有细胞核靶向能力。最后通过静电吸附作用将透明质酸(hyaluronic acid,ha)修饰在pda表面,使载体具有肿瘤细胞靶向性,得到pda/dex-pei@ha(pdph)基因载体。该基因载体具有极低的细胞毒性和较高的转染效率,可以将pt2spcas9重组质粒靶向传递至肿瘤细胞,并靶向传递至细胞核,再将crispr/cas9基因插入细胞基因组中,对靶细胞进行高效的基因编辑。pdph的生物安全性和转染效率远高于其他传统基因载体,是优秀的crispr/cas9基因传递载体。
技术实现要素:
[0005]
本发明的目的是提供一种能够高效传递crispr/cas9系统的基因载体、其制备方法及应用,该基因载体可以将crispr/cas9系统靶向传递至目的细胞,并传递至细胞核,再利用转座子将crispr/cas9系统插入宿主基因组,提高其基因编辑的效率。该基因载体传递效率高、毒性低,生物安全性好,并且制备方法简单,条件温和,拥有广阔的应用前景。
[0006]
第一方面,本发明提供了一种crispr/cas9基因载体,其是一种表面经修饰的聚多巴胺纳米粒,包括聚多巴胺、聚乙烯亚胺、地塞米松和透明质酸,其中,聚多巴胺表面修饰有聚乙烯亚胺、地塞米松和透明质酸,地塞米松通过π-π共轭负载至聚多巴胺表面,聚乙烯亚胺修饰于聚多巴胺表面,透明质酸通过静电吸附作用在聚多巴胺表面。其中,聚多巴胺、聚乙烯亚胺、地塞米松和透明质酸的质量比为5:(2.5-3):(6-7):(5-10)。
[0007]
第二方面,本发明提供了一种如上所述的crispr/cas9基因载体的制备方法,其包括以下步骤:
[0008]
步骤1、将浓度28%的氨水,无水乙醇与去离子水混合均匀,三者的体积比为2:40:(90~180),20℃~40℃搅拌20-30分钟;
[0009]
步骤2、将多巴胺盐酸盐溶解于去离子水中,并滴加至步骤1)中所得混合物溶液中,使得多巴胺盐酸盐的最终浓度为2~7mg/ml,20℃~40℃搅拌反应20-24小时;
[0010]
步骤3、将步骤2)所得产物在12000-13000rpm下离心40~60分钟,水洗3次,得到聚多巴胺纳米粒;
[0011]
步骤4、将步骤3)获得的聚多巴胺纳米粒3-6mg溶于10-20ml去离子水中并加入2.5-5mg的地塞米松粉末,搅拌24h得到聚多巴胺/地塞米松水溶液;
[0012]
步骤5、将步骤4)中所得聚多巴胺/地塞米松水溶液滴加至浓度为10mg/ml聚乙烯亚胺水溶液中,聚多巴胺/地塞米松水溶液与聚乙烯亚胺水溶液的质量比为1:(1~2)搅拌20-24h;可以选择地,聚乙烯亚胺为25k分子量的聚乙烯亚胺或者15k分子量的聚乙烯亚胺;
[0013]
步骤6、将步骤5)获得的反应混合物装入透析袋中(mwco=14000),在蒸馏水中透析,得到聚多巴胺/地塞米松-聚乙烯亚胺溶液。
[0014]
步骤7、将1mg/ml透明质酸的水溶液缓慢滴加到步骤6)中获得的聚多巴胺/地塞米松-聚乙烯亚胺溶液中,透明质酸的水溶液与聚多巴胺/地塞米松-聚乙烯亚胺溶液的质量比为1:(0.5~1),搅拌反应4~6小时,得到目标产物,即上述的crispr/cas9基因载体,表面经修饰的聚多巴胺纳米粒。
[0015]
第三方面,本发明提供了一种基于上述的crispr/cas9基因载体的crispr/cas9系统转染复合物的构建方法,其包括以下步骤:
[0016]
步骤1、crispr/cas9基因载体的制备
[0017]
所述的crispr/cas9基因载体为上述的表面经修饰的聚多巴胺纳米粒,其通过上述的crispr/cas9基因载体的制备方法获得;
[0018]
步骤2、构建携带特异性sgrna的“睡美人”转座子crispr/cas9重组质粒
[0019]
2.1)采用限制性内切酶剪切得到px459质粒中的crispr/cas9系统基因序列;
[0020]
2.2)采用pcr方法扩增携带“睡美人”转座子的pt2bh质粒中的“睡美人”转座子基因序列;
[0021]
2.3)将crispr/cas9系统基因序列与“睡美人”转座子基因序列连接得到pt2spcas9重组质粒;
[0022]
2.4)将特异性sgrna退火后插入步骤2.3)中获得的pt2spcas9重组质粒中,得到携带特异性sgrna的pt2spcas9重组质粒。
[0023]
步骤3、crispr/cas9基因载体负载携带特异性sgrna的pt2spcas9重组质粒
[0024]
将步骤2)中获得的携带特异性sgrna的pt2spcas9重组质粒缓慢加入步骤1)中的
crispr/cas9基因载体的中,涡旋振荡,室温孵育20-30min即得crispr/cas9系统转染复合物。
[0025]
进一步地,步骤2.1)中所述的限制性内切酶为ecori和sacii。
[0026]
进一步地,步骤2.2)中所述的pcr方法扩增的具体步骤为:
①
92℃反应5min;
②
92℃反应30s;
③
56℃反应30s;
④
68℃反应1min;
⑤
将步骤
②
~
④
重复30个循环;
⑥
68℃反应15min。所使用的正向引物序列为5
’-
ccggaattccgggctaccaaatactaattg-3
’
;反向引物序列为5
’-
tccccgcggacagtcaactt-3
’
。
[0027]
进一步地,步骤2.1)中所获得的crispr/cas9系统基因序列如seq id no.10所示;步骤2.2)中所获得的“睡美人”转座子序列如seq id no.9所示。
[0028]
进一步地,步骤2.4)中所述的特异性sgrna退火的具体步骤为:
①
37℃反应30-35min;
②
以3-5℃/min速度从95℃降至25℃。
[0029]
进一步地,步骤2.4)中所述的特异性sgrna包括但不限于nanog基因的sgrna。
[0030]
进一步地,步骤3)中携带特异性sgrna的pt2spcas9重组质粒与crispr/cas9基因载体的质量比为1:(5~30)。
[0031]
本发明的有益效果为:载体中的ha,使pda/dex-pei@ha具有肿瘤细胞靶向性;载体中的dex使pda/dex-pei@ha具有细胞核靶向性;“睡美人”转座子具有强大的转座能力,能将crispr/cas9系统插入宿主基因组。因此pda/dex-pei@ha具有细胞靶向性,细胞核靶向性,基因转座能力,三者协同作用提高crispr/cas9的基因编辑效率,而pda/dex-pei@ha的细胞毒性低,生物安全性高,并且制备方法简单,条件温和,是优秀的crispr/cas9基因传递载体。
附图说明
[0032]
图1为用pcr方法扩增“睡美人”转座子pt2bh质粒中转座子基因的电泳鉴定图;
[0033]
图2为用限制性内切酶剪切得到px459质粒中的crispr/cas9系统的电泳鉴定图;
[0034]
图3(a)和图3(b)为pt2spcas9重组质粒的酶切电泳鉴定图,图3(a)ecori酶切,图3(b)sacii酶切;
[0035]
图4(a)和图4(b)为对pt2spcas9重组质粒进行pcr鉴定图,图4(a)用u6引物进行pcr,图4(b)用pt2bh引物对进行pcr;
[0036]
图5为pt2spcas9-nanog重组质粒的基因测序结果图;
[0037]
图6(a)至图6(e)为pdph基因载体的红外光谱图:图6(a)pda、图6(b)dex、图6(c)ha、图6(d)pdph
10k
、图6(e)pdph
25k
;
[0038]
图7(a)至图7(c)为pdph基因载体的透射电镜图:图7(a)pda、图7(b)pdph
25k
/dna、图7(c)pdph
10k
/dna;
[0039]
图8为pdph
10k
和pdph
25k
凝胶缓滞图;
[0040]
图9为pdph
25k
和pdph
10k
的转染效率对比图;
[0041]
图10为pph
25k
、pdp
25k
和pdph
25k
的转染效率对比图;
[0042]
图11为经过ha抑制后pdph
25k
的转染效率对比图;
[0043]
图12,其包a-d,为pdph
25k
和pdph
10k
的细胞内分布结果图:图12中的a和b为转染2h后、图12中的c和d为转染4h后;
[0044]
图13为pei
10k
、pei
25k
、dex、pdph
25k
和pdph
10k
的细胞毒性结果图;
[0045]
图14为pdph
25k
传递pt2spcas9-nanog后的细胞划痕结果图;
[0046]
图15为western blot检测基因转染后nanog蛋白的敲除结果图;
[0047]
图16为pcr法验证pt2spcas9-nanog插入宿主基因组的结果图。
具体实施方式
[0048]
以下结合附图,通过实施例进一步说明本发明,但不作为对本发明的限制。以下提供了本发明实施方案中所使用的具体材料及其来源。但是,应当理解的是,这些仅仅是示例性的,并不意图限制本发明,与如下试剂和仪器的类型、型号、品质、性质或功能相同或相似的材料均可以用于实施本发明。下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
[0049]
有关本发明的前述及其技术内容、特点与功效,在以下配合参考附图的实施例的详细说明中,将可清楚的呈现。
[0050]
除非另外说明,本文中的术语“聚多巴胺”指的是由多巴胺在碱性加热条件下自聚所得,在附图中以缩写“pda”表示。
[0051]
除非另外说明,本文中的术语“地塞米松”,在附图中以缩写“dex”表示。
[0052]
除非另外说明,本文中的术语“pda-pei-ha”指的是使用上述聚多巴胺为载体,修饰透明质酸和聚乙烯亚胺所形成的复合物,在附图中以缩写“pph”表示。
[0053]
除非另外说明,本文中的术语“pda/dex-pei”指的是使用上述聚多巴胺为载体,负载地塞米松和聚乙烯亚胺所形成的复合物,在附图中以缩写“pdp”表示。
[0054]
除非另外说明,本文中的术语“pda/dex-pei@ha”指的是使用上述聚多巴胺为载体,负载地塞米松并修饰透明质酸和聚乙烯亚胺所形成的复合物,在附图中以缩写“pdph”表示。
[0055]
除非另外说明,本文中的术语“pph
25k”指的是使用上述聚多巴胺为载体,修饰透明质酸和25k分子量的聚乙烯亚胺所形成的复合物。
[0056]
除非另外说明,本文中的术语“pdp
25k”指的是使用上述聚多巴胺为载体,负载地塞米松并用25k分子量的聚乙烯亚胺所形成的复合物。
[0057]
除非另外说明,本文中的术语“pdph
25k”指的是使用上述聚多巴胺为载体,负载地塞米松并用透明质酸和25k分子量的聚乙烯亚胺所形成的复合物。
[0058]
实施例1:“睡美人”转座子crispr/cas9重组质粒的构建
[0059]
1)对pt2bh(购自addgene:#26556)质粒中的“睡美人”转座子序列进行pcr扩增。pcr反应体系为:5ng/μl的pt2bh质粒6μl、5μl的10
×
beyofusion buffer(with mg
2+
)、10μl的dntps(每种均为2.5mm)、引物各2μl(每种均为10mm)、1μl的fusion聚合酶(2.5u/μl)以及24μl的灭菌水。
[0060]
pt2bh引物序列如下:
[0061]
pt2bh-f:5
’-
ccggaattccgggctaccaaatactaattg-3
’
(seq id no.1)
[0062]
pt2bh-r:5
’-
tccccgcggacagtcaactt-3
’
(seq id no.2)
[0063]
pcr反应程序为:
[0064]
①
92℃反应5min;
②
92℃反应30s;
③
56℃反应30s;
④
68℃反应1min;
⑤
将步骤
②
~
④
重复30个循环;
⑥
68℃反应15min。
[0065]
经过琼脂糖凝胶电泳鉴定,pcr扩增所得“睡美人”转座子序列长度为3.3kb,具体序列为除去345bp到531bp之间剩余的全部序列(seq id no.9),结果如图1所示。
[0066]
2)对“睡美人”转座子的pcr扩增产物和px459质粒(购自addgene:#62988)进行双酶切。酶切反应体系为:px459质粒或者pcr扩增产物1μg,2μl的10
×
buffer(t),ecori和sacii各1μl,2μl的0.1%bsa,9μl的灭菌水,在37℃水浴锅中反应2h。
[0067]
所得的双酶切产物用凝胶电泳鉴定,并切胶回收与纯化。结果如图2所示,px459质粒酶切得到crispr/cas9基因的长度为6.47kb(seq id no.10),“睡美人”转座子基因长度为3.3kb。
[0068]
3)双酶切产物连接得到重组质粒。连接反应体系如下:“睡美人”转座子的pcr后的双酶切产物50ng,px459质粒的双酶切产物250ng,10
×
t4连接酶buffer 5μl,t4连接酶1μl,10μl的灭菌水。上述体系在4℃下反应12h,即得连接产物。将其转化至感受态细胞中,在37℃下培养过夜。取若干转化后的菌落加入10ml的含有氨苄青霉素的液体lb培养基中在250rpm,37℃条件下振荡培养过夜后提取质粒,即得pt2spcas9重组质粒,其长度为9.8kb。
[0069]
4)pt2spcas9重组质粒的鉴定。
[0070]
首先,用ecori或sacii对pt2spcas9进行酶切鉴定,酶切反应体系为:pt2spcas9 1μg,10
×
buffer(t)2μl,ecori或sacii 1μl,灭菌水9μl。将酶切反应体系在37℃水浴中反应2h,用凝胶电泳鉴定,以pt2bh、px459质粒作为对照。结果如图3(a),图3(b)所示,由于pt2spcas9中ecori和sacii的酶切位点均只有一个,所得酶切产物为9.8kb,与pt2bh、px459质粒的酶切产物不同,因此可判断重组质粒制备成功。
[0071]
然后用pcr方法对重组质粒pt2spcas9中的crispr/cas9系统序列以及“睡美人”转座子序列进行验证,分别使用u6引物和pt2bh引物。pcr反应体系为:重组质粒10ng,5μl的10
×
beyo fusion buffer(with mg
2+
),10μl的dntps((每种均为2.5mm)),引物对各2μl(每种均为10mm),1μl的fusion聚合酶(2.5u/μl),8μl灭菌水。
[0072]
u6引物的序列如下:
[0073]
u6-f:5
’-
cccaagcttagaattggcgcacgc-3
’
(seq id no.3)
[0074]
u6-r:5
’-
ggactagtgcgagggcctatttccc-3
’
(seq id no.4)
[0075]
用u6引物进行的pcr反应程序为:
①
94℃反应5min;
②
94℃反应30s;
③
57℃反应30s;
④
72℃反应90s;
⑤
将步骤
②
~
④
重复30个循环;
⑥
72℃反应15min。
[0076]
结果如图4(a)所示,扩增得到长度为414bp的基因片段,说明pt2spcas9中含有crispr/cas9系统的相关序列。
[0077]
pt2bh引物的序列如上所述。
[0078]
用pt2bh引物进行的pcr反应程序为:
[0079]
①
92℃反应5min;
②
92℃反应30s;
③
56℃反应30s;
④
68℃反应1min;
⑤
将步骤
②
~
④
重复30个循环;
⑥
68℃反应15min。
[0080]
结果如图4(b)所示,扩增出的序列长度为3.3kb,说明pt2spcas9含有“睡美人”转座子的相关序列,因此可判断重组载体制备成功。
[0081]
(2)pt2spcas9-nanog质粒的制备
[0082]
本发明以nanog基因为例,构建靶向nanog基因的pt2spcas9-nanog质粒,验证其基
因编辑效率。靶向nanog基因的sgrna序列为:
[0083]
nanog-sgrna-f:5
’-
caccggtagctgaggttcaggatgt-3
’
(seq id no.5)
[0084]
nanog-sgrna-r:5
’-
aaacacatcctgaacctcagctacc-3
’
(seq id no.6)
[0085]
将上述合成的sgrna进行退火及磷酸化,退火反应体系为:两条sgrna各1μl(100um),t4 pnk酶1μl,10
×
buffer 1μl,灭菌水6μl。反应程序为:
①
37℃反应30min;
②
95℃
→
25℃(5℃/min),得到nanog-sgrna。
[0086]
用bbsi内切酶对pt2spcas9质粒进行酶切,酶切反应体系为:pt2spcas9质粒1μg,10
×
buffer(g)2μl,bbsi限制性核酸内切酶1μl,灭菌水12μl。将反应体系在37℃水浴条件下反应2h,得到酶切产物。
[0087]
取上述酶切产物50ng,nanog-sgrna(1:200稀释)1μl,t4连接酶1μl,10
×
buffer 1μl,灭菌水3μl,在4℃下反应16h,得到pt2spcas9-nanog。
[0088]
对pt2spcas9-nanog进行基因测序鉴定,结果如图5所示,表明nanog-sgrna成功插入pt2spcas9,成功得到pt2spcas9-nanog质粒。
[0089]
实施例2:pda/dex-pei@ha(pdph)纳米粒的制备
[0090]
将氨水(浓度28%),无水乙醇与去离子水混合均匀,三者的体积比为2:40:(90~180),20℃~40℃搅拌30分钟。将多巴胺盐酸盐溶解于去离子水中,滴加至上述混合物溶液中(多巴胺盐酸盐的最终浓度为2~7mg/ml),20℃~40℃搅拌反应24小时,将产物在13000rpm下离心40~60分钟,水洗3次,得到pda纳米粒。将上述获得的pda纳米粒(3-6mg)溶于10-20ml去离子水中并加入2.5-5mg的dex粉末,搅拌24h得到pda/dex。将所得pda/dex滴加至pei
25k
或pei
10k
的水溶液(浓度10mg/ml)中,pda/dex与pei的质量比为1:(1~2),搅拌24h,将反应混合物装入透析袋中(mwco=14000),在蒸馏水中透析72小时,得到pda/dex-pei。将ha的水溶液(1mg/ml)缓慢滴加到pda/dex-pei中,ha与pda/dex-pei的质量比为1:(0.5~1),搅拌反应4~6小时,得到目标产物pda/dex-pei@ha。
[0091]
在制备pdph时不加入dex即得到pph,pdp为制备pdph时未加入ha的产物,pp为制备pdph时未加入dex和ha的产物。以pph,pdp,pp作为pdph的对照。
[0092]
实施例3:pdph/pt2spcas9-nanog转染复合物的制备
[0093]
将pt2spcas9-nanog缓慢加入pda/dex-pei@ha中,两者的质量为1:(5~30),涡旋振荡,室温孵育30min即得。
[0094]
图6(a)至图6(e)为本发明实施例2中制备所得pda/dex-pei@ha的红外光谱图,图6(a)为pda,图6(b)为dex,图6(c)为ha,图6(d)为pdph
10k
,图6(e)为pdph
25k
。图谱显示ch
2
骨架的特征峰位置为2924cm-1
和2890cm-1
,透明质酸中c-o-c基团的特征峰位置为1151cm-1
左右,在以上两种不同分子量(pdph
25k
和pdph
10k
)中均有体现,即验证了dex,pei,ha的成功修饰。
[0095]
图7(a)至图7(c)为本发明实施例3中制备所得pdph
25k
和pdph
10k
与dna复合物的透射电镜图,其中图7(a)为pda,图7(b)为pdph
25k
与dna复合物,图7(c)为pdph
10k
与dna复合物。pda的平均粒径在110nm左右,pdph
25k
和pdph
10k
与dna复合物的平均粒径约为120nm左右,表1为动态光散射法(dls)测定pdph与dna在不同质量比时的粒径和电位结果。
[0096]
表1:不同质量比的pdph/dna复合物的粒径和电位结果
[0097][0098][0099]
图8为本发明实施例3中制备所得pdph
25k
和pdph
10k
的dna凝胶缓滞图,每孔加入1μgdna,并按照不同质量比加入pdph
25k
和pdph
10k
,结果说明pdph
25k
和pdph
10k
与dna的质量比大于4:1时,能完全负载dna,进行有效的基因传递。
[0100]
实施例4:转染效率测定
[0101]
(1)pdph
25k
和pdph
10k
的转染效率测定
[0102]
将hela细胞接种于24孔板中密度为2.5
×
10
5
个细胞/孔,培养24h后,取2μg pegfp-n1质粒与pdph
25k
和pdph
10k
按5:1,10:1,15:1,20:1的质量比,分别孵育30分钟,用500μl不含血清的培养基稀释并加入孔中;继续孵育24h后,裂解细胞,取细胞内总蛋白,用酶标仪于488nm波长激发,在520nm波长处检测荧光强度。以下所有转染效率测定的实验步骤均与该实施例同。结果如图9所示,pdph
25k
的转染效率明显高于pdph
10k
,pdph
25k
与dna的质量比为10:1时,转染效率最高。
[0103]
(2)pph
25k
、pdp
25k
和pdph
25k
的转染效率对比
[0104]
用pdph
25k
转染基因至hela细胞,并用pph
25k
、pdp
25k
作为对照。结果如图10所示,pdph
25k
的转染效率明显高于pph
25k
和pdp
25k
,说明ha和dex能显著提高纳米粒的转染效率,这是由于ha具有肿瘤细胞靶向作用,dex具有细胞核靶向作用,能够将目的基因靶向传递至靶细胞和细胞核,提高传递效率。
[0105]
(3)ha抑制后pdph
25k
的转染效率
[0106]
本发明使用4mg/ml的ha与hela细胞预培养4小时,再用pdph
25k
进行细胞转染。结果如图11所示,用ha封闭hela细胞上的ha受体后,pdph
25k
的转染效率显著降低,证明pdph
25k
中的ha具有肿瘤细胞靶向性。
[0107]
实施例5:pdph
25k
和pdph
10k
的细胞内分布结果图
[0108]
将hela细胞接种于24孔板中,密度为2.5
×
10
5
个细胞/孔,培养24h。将dna用fam荧
光标记,然后按照实施例3的方法,将纳米粒与dna-fam混合制备(a)pdp
10k
/dna、(b)pdph
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/dna、(c)pdp
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/dna、(d)pdph
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/dna、(e)pp
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/dna、(f)pph
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/dna、(g)pp
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/dna、(h)pph
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/dna复合物,然后在细胞中分别加入以上复合物,再继续培养2h(图12中的a,图12中的b)或4h(图12中的c,图12中的d),用激光共聚焦显微镜观察。结果表明,含有dex的pdp
10k
、pdp
25k
、pdph
10k
、pdph
25k
纳米粒能够将dna传递至细胞核(如图中箭头所指);而不含有dex的pp
10k
、pp
25k
、pph
10k
、pph
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纳米粒没有将dna传递至细胞核。相比其它纳米粒,同时含有dex和ha的pdph
10k
、pdph
25k
纳米粒,能将更多的dna传递至细胞核。转染4h的处理组中细胞核的荧光强度明显高于转染2h的处理组。这说明dex具有细胞核靶向性,ha具有细胞靶向性,且随着转染时间的增加,dna的摄取明显增加。
[0109]
实施例6:pdph的细胞毒性
[0110]
将hela细胞接种于96孔板中,密度为5
×
10
3
个细胞/孔,培养24h后分别加入1、10、20、50、100μg/ml的pei
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、pei
10k
、dex、pdph
25k
、pdph
10k
;孵育48h后加入20μl mtt继续孵育4h,弃去培养液,用100μl dmso溶解紫色结晶,用酶标仪于492nm下读取od值,并计算细胞存活率。结果如图13所示,在检测浓度内,pdph
25k
和pdph
10k
均没有毒性,细胞活性都大于80%的,而pei
25k
、pei
10k
具有明显的细胞毒性,说明pdph的毒性低,具较高的生物相容性,适合临床应用。
[0111]
实施例7:细胞划痕实验
[0112]
将hela细胞接种于24孔板中,密度为2.5
×
10
5
个细胞/孔,培养24h后,取2μg pt2spcas9-nanog质粒加入20μg pdph
25k
的水溶液,涡旋振荡,室温孵育30分钟,用500μl无血清培养基稀释后,与hela细胞孵育24h,然后换为含2%血清的培养基,对细胞进行划痕处理,继续培养细胞,在0h,6h,12h,24h进行拍照对比。结果如图14所示,未使用pdph
25k
/pt2spcas9-nanog转染的空白对照组在24h后细胞划痕宽度明显减少,说明细胞具有迁移能力。而经过pdph
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/pt2spcas9-nanog转染的细胞,在敲除nanog基因后,未观察到明显的细胞愈合现象,细胞已经不具备迁移能力。
[0113]
实施例8:western blot检测nanog基因的敲除
[0114]
将hela细胞接种于24孔板中,密度为2.5
×
10
5
个细胞/孔,培养24h后,取pt2spcas9-nanog质粒2μg加入20μg pdph
25k
或pdph
10k
,涡旋振荡,室温孵育30分钟,用500μl无血清培养基稀释后,加入细胞中孵育48h,裂解细胞并提取细胞总蛋白,通过western blot检测细胞内nanog蛋白的含量。结果如图15所示,相比于空白对照组,pdph
25k
或pdph
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转染组的nanog基因表达明显降低,说明用pdph传递pt2spcas9-nanog后,能够有效敲除nanog基因,导致nanog蛋白表达水平显著降低。
[0115]
实施例9:pcr法验证pt2spcas9-nanog插入宿主基因组
[0116]
将hela细胞接种于24孔板中密度为2.5
×
10
5
个细胞/孔,培养24h后,取pt2spcas9-nanog质粒2μg加入20μg pdph
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的水溶液中,涡旋振荡,室温孵育30分钟,用500μl无血清培养基稀释后,加入细胞中孵育48h,裂解细胞并提取细胞基因组dna,用pcr法检测细胞基因组中是否插入了crispr/cas9基因。
[0117]
pcr反应体系为:细胞基因组dna 150ng,引物各1.6μl(10μm),taq dna聚合酶0.1μl,dntp 1.6μl,10
×
buffer 2μl,灭菌水12μl。
[0118]
pcr引物为:
[0119]
u6-f-2:5
’-
gagggcctatttcccatgattccttc-3
’
(seq id no.7)
[0120]
u6-r-2:5
’-
atttgtctgcagaattggcgcac-3
’
(seq id no.8)
[0121]
pcr反应程序为:
①
94℃反应3min;
②
94℃反应30s;
③
54℃反应30s;
④
72℃反应45s;
⑤
将步骤
②
~
④
重复30个循环;
⑥
72℃反应15min。
[0122]
结果如图16所示,用pdph
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仅转染pt2spcas9质粒的对照组,细胞基因组中未扩增出crispr/cas9基因的相关条带,说明crispr/cas9基因没有被插入细胞基因组中;而用pdph
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转染pt2spcas9+sb11(睡美人转座酶)的实验组扩增得到长度410bp的片段,符合预期,说明转座子能够将crispr/cas9基因插入细胞基因组内,从而提高其基因编辑效率。
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